為全面完成重慶市第三次畜禽遺傳資源普查工作，徹底摸清重慶市畜禽遺傳資源狀況，重慶市委、市政府高位推動，市農業農村委、市商務委及時成立工作專班，并在市畜牧總站設立了普查工作辦公室，負責日常工作。全面完成了40個區（縣）1031個鄉鎮11233個行政村的面上普查任務，實現了畜禽品種、行政區域兩個全覆蓋。
堅持高位推動。重慶市主要領導和分管領導多次召開普查專題會議，明確目標任務，要求各級政府和業務部門要主動對標對表，采取有力措施、強化技術支撐、落實普查經費，2021年市級落實普查專項資金580萬元、部分區（縣）配套280萬元，確保高質量完成畜禽普查工作。
提高組織化程度。重慶市、區（縣）兩級均設立普查辦公室、組建專家組，組成普查隊伍6714人、技術專家組510人。實行市級專家分片包區（縣）、區（縣）專家分片包鄉鎮，制定了普查工作指南、技術路線圖和時間表，穩步推進普查工作。同時，市、區（縣）專家在做好人員培訓的基礎上，采取以督代訓的形式，開展督導幫扶、現場指導1萬多人次。
落實職能職責。重慶市結合自身實際，分畜種細化工作方案，按畜種、分區（縣）落實責任到人，以問題為導向，對進展緩慢畜種和重視不夠的區（縣）、鄉鎮，針對性組織專家開展培訓、指導、督促和幫扶，推動普查工作精準落地。
建立考核制度。重慶市把畜禽遺傳資源普查工作作為重要內容納入全市鄉村振興考核，加強目標管理和過程管理，建立定期調度、實時跟蹤，從2021年7月份起進行月調度、月排名、月通報。加強數據質量控制，制定了數據質量控制方案，實行分階段、分層級審核制度，確保數據的完整性、真實性、準確性。
實施邊普邊保。一邊全面做好面上普查，一邊開展畜禽遺傳資源保護。2021年安排專項資金1400萬元，重點保護地方畜禽資源11個，確立市級畜禽種質資源保護單位22家，發布《重慶市畜禽遺傳資源保護名錄》，創新了保種方式，制定了保種方案，細化了職能職責，開展了性能測定，進行了鑒定評價，培育出榮昌豬、大足黑山羊國家級保種場區3個。
